PT  - JOURNAL ARTICLE
AU  - International Multiple Sclerosis Genetics Consortium
AU  - NA Patsopoulos
AU  - SE Baranzini
AU  - A Santaniello
AU  - P Shoostari
AU  - C Cotsapas
AU  - G Wong
AU  - AH Beecham
AU  - T James
AU  - J Replogle
AU  - I Vlachos
AU  - C McCabe
AU  - T Pers
AU  - A Brandes
AU  - C White
AU  - B Keenan
AU  - M Cimpean
AU  - P Winn
AU  - IP Panteliadis
AU  - A Robbins
AU  - TFM Andlauer
AU  - O Zarzycki
AU  - B Dubois
AU  - A Goris
AU  - H Bach Sondergaard
AU  - F Sellebjerg
AU  - P Soelberg Sorensen
AU  - H Ullum
AU  - L Wegner Thoerner
AU  - J Saarela
AU  - I Cournu Rebeix
AU  - V Damotte
AU  - B Fontaine
AU  - L Guillot Noel
AU  - M Lathrop
AU  - S Vukusik
AU  - A Berthele
AU  - V Biberacher
AU  - D Buck
AU  - C Gasperi
AU  - C Graetz
AU  - V Grummel
AU  - B Hemmer
AU  - M Hoshi
AU  - B Knier
AU  - T Korn
AU  - CM Lill
AU  - F Luessi
AU  - M Mühlau
AU  - F Zipp
AU  - E Dardiotis
AU  - C Agliardi
AU  - A Amoroso
AU  - N Barizzone
AU  - MD Benedetti
AU  - L Bernardinelli
AU  - P Cavalla
AU  - F Clarelli
AU  - G Comi
AU  - D Cusi
AU  - F Esposito
AU  - L Ferrè
AU  - D Galimberti
AU  - C Guaschino
AU  - MA Leone
AU  - V Martinelli
AU  - L Moiola
AU  - M Salvetti
AU  - M Sorosina
AU  - D Vecchio
AU  - A Zauli
AU  - S Santoro
AU  - M Zuccalà
AU  - J Mescheriakova
AU  - C van Duijn
AU  - SD Bos
AU  - EG Celius
AU  - A Spurkland
AU  - M Comabella
AU  - X Montalban
AU  - L Alfredsson
AU  - I Bomfim
AU  - D Gomez-Cabrero
AU  - J Hillert
AU  - M Jagodic
AU  - M Lindén
AU  - F Piehl
AU  - I Jelčić
AU  - R Martin
AU  - M Sospedra
AU  - A Baker
AU  - M Ban
AU  - C Hawkins
AU  - P Hysi
AU  - S Kalra
AU  - F Karpe
AU  - J Khadake
AU  - G Lachance
AU  - P Molyneux
AU  - M Neville
AU  - J Thorpe
AU  - E Bradshaw
AU  - SJ Caillier
AU  - P Calabresi
AU  - BAC Cree
AU  - A Cross
AU  - M Davis
AU  - PWI de Bakker
AU  - S Delgado
AU  - M Dembele
AU  - K Edwards
AU  - K Fitzgerald
AU  - IY Frohlich
AU  - PA Gourraud
AU  - JL Haines
AU  - H Hakonarson
AU  - D Kimbrough
AU  - N Isobe
AU  - I Konidari
AU  - E Lathi
AU  - MH Lee
AU  - T Li
AU  - D An
AU  - A Zimmer
AU  - A Lo
AU  - L Madireddy
AU  - CP Manrique
AU  - M Mitrovic
AU  - M Olah
AU  - E Patrick
AU  - MA Pericak-Vance
AU  - L Piccio
AU  - C Schaefer
AU  - H Weiner
AU  - K Lage
AU  - A Compston
AU  - D Hafler
AU  - HF Harbo
AU  - SL Hauser
AU  - G Stewart
AU  - S D’Alfonso
AU  - G Hadjigeorgiou
AU  - B Taylor
AU  - LF Barcellos
AU  - D Booth
AU  - R Hintzen
AU  - I Kockum
AU  - F Martinelli-Boneschi
AU  - JL McCauley
AU  - JR Oksenberg
AU  - A Oturai
AU  - S Sawcer
AU  - AJ Ivinson
AU  - T Olsson
AU  - PL De Jager
AU  - Murray Barclay
AU  - Laurent Peyrin-Biroulet
AU  - Mathias Chamaillard
AU  - Jean-Frederick Colombe
AU  - Mario Cottone
AU  - Anthony Croft
AU  - Renata D’Incà
AU  - Jonas Halfvarson
AU  - Katherine Hanigan
AU  - Paul Henderson
AU  - Jean-Pierre Hugot
AU  - Amir Karban
AU  - Nicholas A Kennedy
AU  - Mohammed Azam Khan
AU  - Marc Lémann
AU  - Arie Levine
AU  - Dunecan Massey
AU  - Monica Milla
AU  - Grant W Montgomery
AU  - Sok Meng Evelyn Ng
AU  - Ioannis Oikonomou
AU  - Harald Peeters
AU  - Deborah D. Proctor
AU  - Jean-Francois Rahier
AU  - Rebecca Roberts
AU  - Paul Rutgeerts
AU  - Frank Seibold
AU  - Laura Stronati
AU  - Kirstin M Taylor
AU  - Leif Törkvist
AU  - Kullak Ublick
AU  - Johan Van Limbergen
AU  - Andre Van Gossum
AU  - Morten H. Vatn
AU  - Hu Zhang
AU  - Wei Zhang
AU  - Australia and New Zealand IBDGC
AU  - Belgium Genetic Consortium
AU  - Initiative on Crohn and Colitis
AU  - NIDDK IBDGC
AU  - United Kingdom IBDGC
AU  - Wellcome Trust Case Control Consortium
TI  - The Multiple Sclerosis Genomic Map: Role of peripheral immune cells and resident microglia in susceptibility
AID  - 10.1101/143933
DP  - 2017 Jan 01
TA  - bioRxiv
PG  - 143933
4099  - http://biorxiv.org/content/early/2017/07/13/143933.short
4100  - http://biorxiv.org/content/early/2017/07/13/143933.full
AB  - We assembled and analyzed genetic data of 47,351 multiple sclerosis (MS) subjects and 68,284 control subjects and establish a reference map of the genetic architecture of MS that includes 200 autosomal susceptibility variants outside the major histocompatibility complex (MHC), one chromosome X variant, and 32 independent associations within the extended MHC. We used an ensemble of methods to prioritize up to 551 potentially associated MS susceptibility genes, that implicate multiple innate and adaptive pathways distributed across the cellular components of the immune system. Using expression profiles from purified human microglia, we do find enrichment for MS genes in these brain - resident immune cells. Thus, while MS is most likely initially triggered by perturbation of peripheral immune responses the functional responses of microglia and other brain cells are also altered and may have a role in targeting an autoimmune process to the central nervous system.One Sentence Summary: We report a detailed genetic and genomic map of multiple sclerosis, and describe the role of putatively affected genes in the peripheral immune system and brain resident microglia.