TY - JOUR T1 - Meta-analysis of exome array data identifies six novel genetic loci for lung function JF - bioRxiv DO - 10.1101/164426 SP - 164426 AU - Victoria E Jackson AU - Jeanne C Latourelle AU - Louise V Wain AU - Albert V. Smith AU - Megan L. Grove AU - Traci M Bartz AU - Maen Obeidat AU - Michael A Province AU - Wei Gao AU - Beenish Qaiser AU - David J Porteous AU - Patricia A Cassano AU - Tarunveer S. Ahluwalia AU - Niels Grarup AU - Jin Li AU - Elisabeth Altmaier AU - Jonathan Marten AU - Sarah E Harris AU - Ani Manichaikul AU - Tess D Pottinger AU - Ruifang Li-Gao AU - Allan Lind-Thomsen AU - Anubha Mahajan AU - Lies Lahousse AU - Medea Imboden AU - Alexander Teumer AU - Bram Prins AU - Leo-Pekka Lyytikäinen AU - Gudny Eiriksdottir AU - Nora Franceschini AU - Colleen M Sitlani AU - Jennifer A Brody AU - Yohan Bossé AU - Wim Timens AU - Aldi Kraja AU - Anu Loukola AU - Wenbo Tang AU - Yongmei Liu AU - Jette Bork-Jensen AU - Johanne M. Justesen AU - Allan Linneberg AU - Leslie A. Lange AU - Rajesh Rawal AU - Stefan Karrasch AU - Jennifer E Huffman AU - Blair H Smith AU - Gail Davies AU - Kristin M Burkart AU - Josyf C Mychaleckyj AU - Tobias N. Bonten AU - Stefan Enroth AU - Lars Lind AU - Guy G Brusselle AU - Ashish Kumar AU - Beate Stubbe AU - Understanding Society Scientific Group AU - Mika Kähönen AU - Annah B. Wyss AU - Bruce M Psaty AU - Susan R Heckbert AU - Ke Hao AU - Taina Rantanen AU - Stephen B Kritchevsky AU - Kurt Lohman AU - Tea Skaaby AU - Charlotta Pisinger AU - Torben Hansen AU - Holger Schulz AU - Ozren Polasek AU - Archie Campbell AU - John M Starr AU - Stephen S Rich AU - Dennis O. Mook-Kanamori AU - Åsa Johansson AU - Erik Ingelsson AU - André G Uitterlinden AU - Stefan Weiss AU - Olli T. Raitakari AU - Vilmundur Gudnason AU - Kari E. North AU - Sina A Gharib AU - Don D Sin AU - Kent D Taylor AU - George T O’Connor AU - Jaakko Kaprio AU - Tamara B Harris AU - Oluf Pedersen AU - Henrik Vestergaard AU - James G. Wilson AU - Konstantin Strauch AU - Caroline Hayward AU - Shona Kerr AU - Ian J Deary AU - R Graham Barr AU - Renée de Mutsert AU - Ulf Gyllensten AU - Andrew P Morris AU - M. Arfan Ikram AU - Nicole M Probst-Hensch AU - Sven Gläser AU - Eleftheria Zeggini AU - Terho Lehtimäki AU - David P Strachan AU - Josee Dupuis AU - Alanna C. Morrison AU - Ian P Hall AU - Martin D Tobin AU - Stephanie J London Y1 - 2017/01/01 UR - http://biorxiv.org/content/early/2017/07/17/164426.abstract N2 - Over 90 regions of the genome have been associated with lung function to date, many of which have also been implicated in chronic obstructive pulmonary disease (COPD). We carried out meta-analyses of exome array data and three lung function measures: forced expiratory volume in one second (FEV1), forced vital capacity (FVC) and the ratio of FEV1 to FVC (FEV1/FVC). These analyses by the SpiroMeta and CHARGE consortia included 60,749 individuals of European ancestry from 23 studies, and 7,721 individuals of African Ancestry from 5 studies in the discovery stage, with follow-up in up to 111,556 independent individuals. We identified significant (P<2·8x10-7) associations with six SNPs: a nonsynonymous variant in RPAP1, which is predicted to be damaging, three intronic SNPs (SEC24C, CASC17 and UQCC1) and two intergenic SNPs near to LY86 and FGF10. eQTL analyses found evidence for regulation of gene expression at three signals and implicated several genes including TYRO3 and PLAU. Further interrogation of these loci could provide greater understanding of the determinants of lung function and pulmonary disease. ER -