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sgDI-tector: defective interfering viral genome bioinformatics for detection of coronavirus subgenomic RNAs
View ORCID ProfileAndrea Di Gioacchino, View ORCID ProfileRachel Legendre, Yannis Rahou, Valérie Najburg, Pierre Charneau, Benjamin D Greenbaum, View ORCID ProfileFrédéric Tangy, View ORCID ProfileSylvie van der Werf, View ORCID ProfileSimona Cocco, Anastasia V Komarova
doi: https://doi.org/10.1101/2021.11.30.470527
Andrea Di Gioacchino
1Sorbonne Université, Université de Paris, Laboratoire de Physique de l’Ecole Normale Supérieure, PSL & CNRS UMR8063, 24 rue Lhomond, 75005, Paris, France
Rachel Legendre
2Institut Pasteur, Université de Paris, Hub de Bioinformatique et Biostatistique - Département Biologie Computationnelle, 25-28 rue du Docteur Roux, 75015, Paris, France
Yannis Rahou
3Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3569, Génétique Moléculaire des Virus à ARN, F-75015 Paris, France
Valérie Najburg
4Institut Pasteur, Université de Paris, Laboratory of Innovative Vaccines, 25-28 rue du Docteur Roux, 75015, Paris, France
Pierre Charneau
5Institut Pasteur, Pasteur-TheraVectys joined unit, 25-28 rue du Docteur Roux, 75015, Paris, France
Benjamin D Greenbaum
6Computational Oncology, Department of Epidemiology and Biostatistics, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, 1275 York Avenue, 10065, New York, USA
7Physiology, Biophysics & Systems Biology, Weill Cornell Medicine, Weill Cornell Medical College, 1300 York Avenue, 10065, New York, USA
Frédéric Tangy
4Institut Pasteur, Université de Paris, Laboratory of Innovative Vaccines, 25-28 rue du Docteur Roux, 75015, Paris, France
Sylvie van der Werf
3Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3569, Génétique Moléculaire des Virus à ARN, F-75015 Paris, France
Simona Cocco
1Sorbonne Université, Université de Paris, Laboratoire de Physique de l’Ecole Normale Supérieure, PSL & CNRS UMR8063, 24 rue Lhomond, 75005, Paris, France
Anastasia V Komarova
3Institut Pasteur, Université de Paris, CNRS UMR3569, Génétique Moléculaire des Virus à ARN, F-75015 Paris, France
Posted November 30, 2021.
sgDI-tector: defective interfering viral genome bioinformatics for detection of coronavirus subgenomic RNAs
Andrea Di Gioacchino, Rachel Legendre, Yannis Rahou, Valérie Najburg, Pierre Charneau, Benjamin D Greenbaum, Frédéric Tangy, Sylvie van der Werf, Simona Cocco, Anastasia V Komarova
bioRxiv 2021.11.30.470527; doi: https://doi.org/10.1101/2021.11.30.470527
sgDI-tector: defective interfering viral genome bioinformatics for detection of coronavirus subgenomic RNAs
Andrea Di Gioacchino, Rachel Legendre, Yannis Rahou, Valérie Najburg, Pierre Charneau, Benjamin D Greenbaum, Frédéric Tangy, Sylvie van der Werf, Simona Cocco, Anastasia V Komarova
bioRxiv 2021.11.30.470527; doi: https://doi.org/10.1101/2021.11.30.470527
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