PT  - JOURNAL ARTICLE
AU  - Project MinE ALS Sequencing Consortium
AU  - Rick A.A. van der Spek
AU  - Wouter Van Rheenen
AU  - Sara L. Pulit
AU  - Kevin P. Kenna
AU  - Russell L. McLaughlin
AU  - Matthieu Moisse
AU  - Annelot M. Dekker
AU  - Gijs H.P. Tazelaar
AU  - Brendan Kenna
AU  - Kristel R. Van Eijk
AU  - Joke J.F.A. Van Vugt
AU  - Perry T.C. Van Doormaal
AU  - Bas Middelkoop
AU  - Raymond D. Schellevis
AU  - William J. Brands
AU  - Ross Byrne
AU  - Johnathan Cooper-Knock
AU  - Ahmad Al Khleifat
AU  - Yolanda Campos
AU  - Atay Vural
AU  - Jonathan D. Glass
AU  - Alfredo Iacoangeli
AU  - Aleksey Shatunov
AU  - William Sproviero
AU  - Ersen Kavak
AU  - Tuncay Seker
AU  - Fulya Akçimen
AU  - Cemile Kocoglu
AU  - Ceren Tunca
AU  - Nicola Ticozzi
AU  - Maarten Kooyman
AU  - Alberto G. Redondo
AU  - Ian Blair
AU  - Naomi R. Wray
AU  - Matthew C. Kiernan
AU  - Mamede de Carvalho
AU  - Vivian Drory
AU  - Marc Gotkine
AU  - Peter M. Andersen
AU  - Philippe Corcia
AU  - Philippe Couratier
AU  - Vera Fominyh
AU  - Mayana Zatz
AU  - Miguel Mitne-Neto
AU  - Adriano Chio
AU  - Vincenzo Silani
AU  - Boris Rogelj
AU  - Blaž Koritnik
AU  - Janez Zidar
AU  - Markus Weber
AU  - Guy Rouleau
AU  - Nicolas Dupre
AU  - Ian Mackenzie
AU  - Ekaterina Rogaeva
AU  - Gabriel Miltenberger-Miltenyi
AU  - Lev Brylev
AU  - Ervina Bilić
AU  - Ivana Munitic
AU  - Victoria López Alonso
AU  - Karen E. Morrison
AU  - Stephen Newhouse
AU  - Johnathan Mill
AU  - Pamela J. Shaw
AU  - Christopher E. Shaw
AU  - Monica P. Panades
AU  - Jesus S. Mora
AU  - Wim Robberecht
AU  - Philip Van Damme
AU  - A. Nazli Basak
AU  - Orla Hardiman
AU  - Michael A. Van Es
AU  - Ammar Al-Chalabi
AU  - John E. Landers
AU  - Leonard H. Van den Berg
AU  - Jan H. Veldink
TI  - The Project MinE databrowser: bringing large-scale whole-genome sequencing in ALS to researchers and the public
AID  - 10.1101/377911
DP  - 2018 Jan 01
TA  - bioRxiv
PG  - 377911
4099  - http://biorxiv.org/content/early/2018/07/30/377911.short
4100  - http://biorxiv.org/content/early/2018/07/30/377911.full
AB  - Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a rapidly progressive fatal neurodegenerative disease affecting 1 in 350 people. The aim of Project MinE is to elucidate the pathophysiology of ALS through whole-genome sequencing at least 15,000 ALS patients and 7,500 controls at 30X coverage. Here, we present the Project MinE data browser (databrowser.projectmine.com), a unique and intuitive one-stop, open-access server that provides detailed information on genetic variation analyzed in a new and still growing set of 4,366 ALS cases and 1,832 matched controls. Through its visual components and interactive design, the browser specifically aims to be a resource to those without a biostatistics background and allow clinicians and preclinical researchers to integrate Project MinE data into their own research. The browser allows users to query a transcript and immediately access a unique combination of detailed (meta)data, annotations and association statistics that would otherwise require analytic expertise and visits to scattered resources.