RT Journal Article
SR Electronic
T1 Single-cell transcriptomic characterization of 20 organs and tissues from individual mice creates a <em>Tabula Muris</em>
JF bioRxiv
FD Cold Spring Harbor Laboratory
SP 237446
DO 10.1101/237446
A1 Nicholas Schaum
A1 Jim Karkanias
A1 Norma F Neff
A1 Andrew P. May
A1 Stephen R. Quake
A1 Tony Wyss-Coray
A1 Spyros Darmanis
A1 Joshua Batson
A1 Olga Botvinnik
A1 Michelle B. Chen
A1 Steven Chen
A1 Foad Green
A1 Robert Jones
A1 Ashley Maynard
A1 Lolita Penland
A1 Rene V. Sit
A1 Geoffrey M. Stanley
A1 James T. Webber
A1 Fabio Zanini
A1 Ankit S. Baghel
A1 Isaac Bakerman
A1 Ishita Bansal
A1 Daniela Berdnik
A1 Biter Bilen
A1 Douglas Brownfield
A1 Corey Cain
A1 Michelle B. Chen
A1 Steven Chen
A1 Min Cho
A1 Giana Cirolia
A1 Stephanie D. Conley
A1 Spyros Darmanis
A1 Aaron Demers
A1 Kubilay Demir
A1 Antoine de Morree
A1 Tessa Divita
A1 Haley du Bois
A1 Laughing Bear Torrez Dulgeroff
A1 Hamid Ebadi
A1 F. Hernan Espinoza
A1 Matt Fish
A1 Qiang Gan
A1 Benson M. George
A1 Astrid Gillich
A1 Foad Green
A1 Geraldine Genetiano
A1 Xueying Gu
A1 Gunsagar S. Gulati
A1 Yan Hang
A1 Shayan Hosseinzadeh
A1 Albin Huang
A1 Tal Iram
A1 Taichi Isobe
A1 Feather Ives
A1 Robert Jones
A1 Kevin S. Kao
A1 Guruswamy Karnam
A1 Aaron M. Kershner
A1 Bernhard Kiss
A1 William Kong
A1 Maya E. Kumar
A1 Jonathan Lam
A1 Davis P. Lee
A1 Song E. Lee
A1 Guang Li
A1 Qingyun Li
A1 Ling Liu
A1 Annie Lo
A1 Wan-Jin Lu
A1 Anoop Manjunath
A1 Andrew P. May
A1 Kaia L. May
A1 Oliver L. May
A1 Ashley Maynard
A1 Marina McKay
A1 Ross J. Metzger
A1 Marco Mignardi
A1 Dullei Min
A1 Ahmad N. Nabhan
A1 Norma F Neff
A1 Katharine M. Ng
A1 Joseph Noh
A1 Rasika Patkar
A1 Weng Chuan Peng
A1 Lolita Penland
A1 Robert Puccinelli
A1 Eric J. Rulifson
A1 Nicholas Schaum
A1 Shaheen S. Sikandar
A1 Rahul Sinha
A1 Rene V Sit
A1 Krzysztof Szade
A1 Weilun Tan
A1 Cristina Tato
A1 Krissie Tellez
A1 Kyle J. Travaglini
A1 Carolina Tropini
A1 Lucas Waldburger
A1 Linda J. van Weele
A1 Michael N. Wosczyna
A1 Jinyi Xiang
A1 Soso Xue
A1 Justin Youngyunpipatkul
A1 Fabio Zanini
A1 Macy E. Zardeneta
A1 Fan Zhang
A1 Lu Zhou
A1 Ishita Bansal
A1 Steven Chen
A1 Min Cho
A1 Giana Cirolia
A1 Spyros Darmanis
A1 Aaron Demers
A1 Tessa Divita
A1 Hamid Ebadi
A1 Geraldine Genetiano
A1 Foad Green
A1 Shayan Hosseinzadeh
A1 Feather Ives
A1 Annie Lo
A1 Andrew P. May
A1 Ashley Maynard
A1 Marina McKay
A1 Norma F. Neff
A1 Lolita Penland
A1 Rene V. Sit
A1 Weilun Tan
A1 Lucas Waldburger
A1 Justin Youngyunpipatkul
A1 Joshua Batson
A1 Olga Botvinnik
A1 Paola Castro
A1 Derek Croote
A1 Spyros Darmanis
A1 Joseph L. DeRisi
A1 Jim Karkanias
A1 Angela Pisco
A1 Geoffrey M. Stanley
A1 James T. Webber
A1 Fabio Zanini
A1 Ankit S. Baghel
A1 Isaac Bakerman
A1 Joshua Batson
A1 Biter Bilen
A1 Olga Botvinnik
A1 Douglas Brownfield
A1 Michelle B. Chen
A1 Spyros Darmanis
A1 Kubilay Demir
A1 Antoine de Morree
A1 Hamid Ebadi
A1 F. Hernan Espinoza
A1 Matt Fish
A1 Qiang Gan
A1 Benson M. George
A1 Astrid Gillich
A1 Xueying Gu
A1 Gunsagar S. Gulati
A1 Yan Hang
A1 Albin Huang
A1 Tal Iram
A1 Taichi Isobe
A1 Guruswamy Karnam
A1 Aaron M. Kershner
A1 Bernhard M. Kiss
A1 William Kong
A1 Christin S. Kuo
A1 Jonathan Lam
A1 Benoit Lehallier
A1 Guang Li
A1 Qingyun Li
A1 Ling Liu
A1 Wan-Jin Lu
A1 Dullei Min
A1 Ahmad N. Nabhan
A1 Katharine M. Ng
A1 Patricia K. Nguyen
A1 Rasika Patkar
A1 Weng Chuan Peng
A1 Lolita Penland
A1 Eric J. Rulifson
A1 Nicholas Schaum
A1 Shaheen S. Sikandar
A1 Rahul Sinha
A1 Krzysztof Szade
A1 Serena Y. Tan
A1 Krissie Tellez
A1 Kyle J. Travaglini
A1 Carolina Tropini
A1 Linda J. van Weele
A1 Bruce M. Wang
A1 Michael N. Wosczyna
A1 Jinyi Xiang
A1 Hanadie Yousef
A1 Lu Zhou
A1 Joshua Batson
A1 Olga Botvinnik
A1 Steven Chen
A1 Spyros Darmanis
A1 Foad Green
A1 Andrew P. May
A1 Ashley Maynard
A1 Angela Pisco
A1 Stephen R. Quake
A1 Nicholas Schaum
A1 Geoffrey M. Stanley
A1 James T. Webber
A1 Tony Wyss-Coray
A1 Fabio Zanini
A1 Philip A. Beachy
A1 Charles K. F. Chan
A1 Antoine de Morree
A1 Benson M. George
A1 Gunsagar S. Gulati
A1 Yan Hang
A1 Kerwyn Casey Huang
A1 Tal Iram
A1 Taichi Isobe
A1 Aaron M. Kershner
A1 Bernhard M. Kiss
A1 William Kong
A1 Guang Li
A1 Qingyun Li
A1 Ling Liu
A1 Wan-Jin Lu
A1 Ahmad N. Nabhan
A1 Katharine M. Ng
A1 Patricia K. Nguyen
A1 Nicholas Schaum
A1 Shaheen S. Sikandar
A1 Rahul Sinha
A1 Krzysztof Szade
A1 Kyle J. Travaglini
A1 Carolina Tropini
A1 Bruce M. Wang
A1 Kenneth Weinberg
A1 Michael N. Wosczyna
A1 Sean Wu
A1 Hanadie Yousef
A1 Ben A. Barres
A1 Philip A. Beachy
A1 Charles K. F. Chan
A1 Michael F. Clarke
A1 Spyros Darmanis
A1 Kerwyn Casey Huang
A1 Jim Karkanias
A1 Seung K. Kim
A1 Mark A. Krasnow
A1 Christin S. Kuo
A1 Andrew P. May
A1 Norma Neff
A1 Roel Nusse
A1 Patricia K. Nguyen
A1 Thomas A. Rando
A1 Justin Sonnenburg
A1 Bruce M. Wang
A1 Kenneth Weinberg
A1 Irving L. Weissman
A1 Sean M. Wu
A1 Stephen R. Quake
A1 Tony Wyss-Coray
YR 2018
UL http://biorxiv.org/content/early/2018/03/29/237446.abstract
AB We have created a compendium of single cell transcriptome data from the model organism Mus musculus comprising more than 100,000 cells from 20 organs and tissues. These data represent a new resource for cell biology, revealing gene expression in poorly characterized cell populations and allowing for direct and controlled comparison of gene expression in cell types shared between tissues, such as T-lymphocytes and endothelial cells from distinct anatomical locations. Two distinct technical approaches were used for most tissues: one approach, microfluidic droplet-based 3’-end counting, enabled the survey of thousands of cells at relatively low coverage, while the other, FACS-based full length transcript analysis, enabled characterization of cell types with high sensitivity and coverage. The cumulative data provide the foundation for an atlas of transcriptomic cell biology.