TY - JOUR T1 - Feature-based Molecular Networking in the GNPS Analysis Environment JF - bioRxiv DO - 10.1101/812404 SP - 812404 AU - Louis Felix Nothias AU - Daniel Petras AU - Robin Schmid AU - Kai Dührkop AU - Johannes Rainer AU - Abinesh Sarvepalli AU - Ivan Protsyuk AU - Madeleine Ernst AU - Hiroshi Tsugawa AU - Markus Fleischauer AU - Fabian Aicheler AU - Alexander Aksenov AU - Oliver Alka AU - Pierre-Marie Allard AU - Aiko Barsch AU - Xavier Cachet AU - Mauricio Caraballo AU - Ricardo R. Da Silva AU - Tam Dang AU - Neha Garg AU - Julia M. Gauglitz AU - Alexey Gurevich AU - Giorgis Isaac AU - Alan K. Jarmusch AU - Zdeněk Kameník AU - Kyo Bin Kang AU - Nikolas Kessler AU - Irina Koester AU - Ansgar Korf AU - Audrey Le Gouellec AU - Marcus Ludwig AU - Martin H. Christian AU - Laura-Isobel McCall AU - Jonathan McSayles AU - Sven W. Meyer AU - Hosein Mohimani AU - Mustafa Morsy AU - Oriane Moyne AU - Steffen Neumann AU - Heiko Neuweger AU - Ngoc Hung Nguyen AU - Melissa Nothias-Esposito AU - Julien Paolini AU - Vanessa V. Phelan AU - Tomáš Pluskal AU - Robert A. Quinn AU - Simon Rogers AU - Bindesh Shrestha AU - Anupriya Tripathi AU - Justin J.J. van der Hooft AU - Fernando Vargas AU - Kelly C. Weldon AU - Michael Witting AU - Heejung Yang AU - Zheng Zhang AU - Florian Zubeil AU - Oliver Kohlbacher AU - Sebastian Böcker AU - Theodore Alexandrov AU - Nuno Bandeira AU - Mingxun Wang AU - Pieter C. Dorrestein Y1 - 2019/01/01 UR - http://biorxiv.org/content/early/2019/10/20/812404.abstract N2 - Molecular networking has become a key method used to visualize and annotate the chemical space in non-targeted mass spectrometry-based experiments. However, distinguishing isomeric compounds and quantitative interpretation are currently limited. Therefore, we created Feature-based Molecular Networking (FBMN) as a new analysis method in the Global Natural Products Social Molecular Networking (GNPS) infrastructure. FBMN leverages feature detection and alignment tools to enhance quantitative analyses and isomer distinction, including from ion-mobility spectrometry experiments, in molecular networks. ER -